Евгений Михайлович Мезенцев родился 17 марта 1938 года в Москве.

В 1961 году окончил операторский факультет ВГИКа (мастерская Гальперина).

С 1955 года работал лаборантом кафедры кинооператорского мастерства ВГИКа.

Работал кинооператором Ленинградского ТВ. Снимал игровые, заказные и рекламные фильмы.

Как оператору Мезенцеву довелось работать со многими известными кинорежиссерами: Виктором Трегубовичем, Сергеем Микаэляном, Геннадием Полокой. Он снимал такие фильмы как "На войне, как на войне" (1968), "Интервенция" (1968), "Берег юности" (1969), "Даурия" (1971), "Гроссмейстер" (1972), "Докер" (1973), "Одиножды один" (1974) и др.

Как режиссер Евгений Мезенцев поставил на "Ленфильме" картины "Товарищ Иннокентий" (1981), "Семь счастливых нот" (1981), "Ольга и Константин"(1984) и др.

Среди его работ - документальная лента "Убийство Анны Политковской".

В 1989 году на базе киностудии "Ленфильм" он создал и возглавил студию "Нева", входившую в киноассоциацию "Ленфильм", где он выступил как продюсер экспериментальной картины Евгения Шифферса "Путь царей", фильмов "Анекдоты" (реж. Виктор Титов), "Владимир Святой" (реж. Юрий Томошевский) и др., а также поставил трехсерийный художественно публицистический фильм "Человек в космосе", построенный на уникальных документальных материалах пионеров отечественной космонавтики.

В последние годы Евгений Мезенцев был художественным руководителем Открытого Санкт-Петербургского детского фестиваля искусств и детского фестиваля "Надежда", вел программы о кино на телевизионных каналах Санкт-Петербурга.

Евгений Мезенцев был членом Союза кинематографистов РФ, художественным руководителем и директором киностудии "Новая Нева. Некоммерческое партнерство".

Евгений Михайлович Мезенцев скончался 11 февраля 2010 года в Санкт-Петербурге.